Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm27029A2A4P4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm27029A2A4P4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm27029A2A4P4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm27029A2A4P4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms