Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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