Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms