Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
4933424G06RikA0A140LIP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933424G06RikA0A140LIP3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933424G06RikA0A140LIP3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms