Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTR2

0610012G03Rik, RIKEN cDNA 0610012G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
0610012G03RikA0A0J9YTR2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms