Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Speer4aF8VPX6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Speer4aF8VPX6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms