Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms