Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Speer4aF8VPX6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms