Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam228bQ497Q6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam228bQ497Q6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms