Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kif3aP28741 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Kif3aP28741 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms