Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb3P09026 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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