Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms