Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Kif3aP28741 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kif3aP28741 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms