Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp5Q9Z2P8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp5Q9Z2P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vamp5Q9Z2P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms