Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Crlf3Q9Z2L7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Crlf3Q9Z2L7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Crlf3Q9Z2L7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Crlf3Q9Z2L7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms