Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RfxankQ9Z205 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RfxankQ9Z205 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RfxankQ9Z205 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.5 ms