Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z125

Creb3l1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l1Q9Z125 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Creb3l1Q9Z125 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Creb3l1Q9Z125 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Creb3l1Q9Z125 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Creb3l1Q9Z125 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Creb3l1Q9Z125 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms