Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PapolbQ9WVP6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PapolbQ9WVP6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PapolbQ9WVP6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PapolbQ9WVP6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PapolbQ9WVP6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms