Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp1a4Q9WV27 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp1a4Q9WV27 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp1a4Q9WV27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms