Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim10Q9WUH5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim10Q9WUH5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim10Q9WUH5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim10Q9WUH5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim10Q9WUH5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim10Q9WUH5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim10Q9WUH5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim10Q9WUH5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms