Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0W9

Chrna6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna6Q9R0W9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Chrna6Q9R0W9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Chrna6Q9R0W9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Chrna6Q9R0W9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Chrna6Q9R0W9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms