Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcm1Q9R0L6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcm1Q9R0L6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcm1Q9R0L6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcm1Q9R0L6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcm1Q9R0L6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms