Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2afyQ9QZQ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
H2afyQ9QZQ8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2afyQ9QZQ8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H2afyQ9QZQ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 333.4 ms