Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt3Q9QZ47 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tnnt3Q9QZ47 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnnt3Q9QZ47 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnnt3Q9QZ47 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt3Q9QZ47 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms