Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SpastQ9QYY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SpastQ9QYY8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SpastQ9QYY8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms