Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Snai3Q9QY31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snai3Q9QY31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snai3Q9QY31 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms