Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpc5Q9QX29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpc5Q9QX29 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpc5Q9QX29 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trpc5Q9QX29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trpc5Q9QX29 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Trpc5Q9QX29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trpc5Q9QX29 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trpc5Q9QX29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpc5Q9QX29 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms