Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slamf1Q9QUM4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slamf1Q9QUM4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slamf1Q9QUM4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slamf1Q9QUM4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms