Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rcan3Q9JKK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rcan3Q9JKK0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rcan3Q9JKK0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rcan3Q9JKK0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rcan3Q9JKK0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rcan3Q9JKK0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rcan3Q9JKK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rcan3Q9JKK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms