Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sh3bgrlQ9JJU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bgrlQ9JJU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bgrlQ9JJU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bgrlQ9JJU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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