Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnbip1Q9JJN6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms