Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpf2Q9JJ80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rpf2Q9JJ80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rpf2Q9JJ80 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rpf2Q9JJ80 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rpf2Q9JJ80 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms