Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl28Q9JIL2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccl28Q9JIL2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccl28Q9JIL2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms