Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIK5

Ddx21, Nucleolar RNA helicase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx21Q9JIK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx21Q9JIK5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddx21Q9JIK5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddx21Q9JIK5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ddx21Q9JIK5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ddx21Q9JIK5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms