Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OtofQ9ESF1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
OtofQ9ESF1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OtofQ9ESF1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OtofQ9ESF1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms