Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snap29Q9ERB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snap29Q9ERB0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Snap29Q9ERB0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snap29Q9ERB0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms