Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cyp27a1Q9DBG1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cyp27a1Q9DBG1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cyp27a1Q9DBG1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms