Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem239Q9DA47 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem239Q9DA47 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmem239Q9DA47 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms