Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sgf29Q9DA08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgf29Q9DA08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgf29Q9DA08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgf29Q9DA08 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms