Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9P8

Llcfc1, LLLL and CFNLAS motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Llcfc1Q9D9P8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Llcfc1Q9D9P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Llcfc1Q9D9P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Llcfc1Q9D9P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Llcfc1Q9D9P8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms