Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf138rt1Q9D9M9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf138rt1Q9D9M9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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