Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gtf2e2Q9D902 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gtf2e2Q9D902 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gtf2e2Q9D902 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gtf2e2Q9D902 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms