Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K8

Slc25a39, Solute carrier family 25 member 39, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a39Q9D8K8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc25a39Q9D8K8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc25a39Q9D8K8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc25a39Q9D8K8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc25a39Q9D8K8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc25a39Q9D8K8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc25a39Q9D8K8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc25a39Q9D8K8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms