Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhl40Q9D783 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Klhl40Q9D783 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Klhl40Q9D783 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klhl40Q9D783 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klhl40Q9D783 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms