Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gbe1Q9D6Y9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gbe1Q9D6Y9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gbe1Q9D6Y9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms