Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ca13Q9D6N1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ca13Q9D6N1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ca13Q9D6N1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ca13Q9D6N1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms