Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfn4Q9D6I3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfn4Q9D6I3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfn4Q9D6I3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfn4Q9D6I3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pfn4Q9D6I3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pfn4Q9D6I3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pfn4Q9D6I3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pfn4Q9D6I3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms