Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ptp4a3Q9D658 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ptp4a3Q9D658 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ptp4a3Q9D658 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ptp4a3Q9D658 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms