Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2al3Q9D4U4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
H2al3Q9D4U4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2al3Q9D4U4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms