Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efhd1Q9D4J1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efhd1Q9D4J1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efhd1Q9D4J1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efhd1Q9D4J1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms