Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Fndc8Q9D2H8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fndc8Q9D2H8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fndc8Q9D2H8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fndc8Q9D2H8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fndc8Q9D2H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms